Ola recomendo dar uma lida nesse post para entender melhor diferença entre os tipos de coordenadores zigbee
Via de regra se você quer priorizar o funcionamento pelo HA compre dongle ou bridge que integre com ZHA ou Z2M. Dessa maneira os dispositivos não vao estar disponiveis nos apps dos fabricantes porem a integracao com HA sera muito melhor.
Se quer ter os dispositivos no app do fabricante é necessário usar HUB. Importante lembrar que os HUBS so são compativeis com dispositivos do mesmo fabricante/ecosistema.
Sobre a alexa, qualquer dispositivo integrado ao HA pode ser exposto para a alexa, desde que voce configure acesso remoto ao seu HA.